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Existem algumas formas de se utilizar Docker em ambiente multi-host, uma delas é utilizando Swarm, Weave e Flannel. O flannel é uma das soluções para esse desafio que existe, ou que tem integração com Docker a mais tempo, pois foi desenvolvimento para atender essa mesma demanda desde o inicio, ou seja, não é algo adaptado, mas sim projetado para esse tipo de cenário. Entenda um pouco mais sobre seu funcionamento, instalação e configuração de um ambiente multi-host com Docker utilizando Flannel.