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Com a autenticação em 2 fatores pelo Google Authenticator (que tem apps para iOS, Android e Blackberry), os logins no seu servidor SSH só serão permitidos se o usuário digitar um código numérico gerado no seu smartphone.

O link a seguir descreve a solução, e explica como configurá-la no OpenSSH. (via xmodulo.com - “How to set up two-factor authentication for SSH login on Linux - Linux FAQ”)