Eu entendo que o subversion e o git são de categorias diferentes e por isso é mais difícil compará-las mas entre o git e o mercurial, que são da mesma categoria e com recursos semelhantes, eu tendo a apostar pela escolha do git para o Gnome pelo peso do Linus.

O mercurial e até o subversion, como já foi falado acima, tendem a ser preferidos por projetos de softwares multiplataforma por causa da existência de clientes para plataformas não-POSIX e pela portabilidade em geral (veja o item Portability na comparação cujo link passei antes). Como o Gnome não tem essa necessidade como um fator primordial, aposto que a escolha será pelo git.

Isso não é verdade. O Git tem méritos técnicos que são especialmente interessantes em projetos Open-Source. Uma das vantagens é que ele foi construído especialmente para se trabalhar com branches. Os branches do Git são muito leves e rápidos.
O Subversion é muito bom e possui ferramentas gráficas muito úteis. Porém, a capacidade de trabalhar off-line é importante para equipes geograficamente distribuídas.

http://git.or.cz/gitwiki/GitSvnComparsion

mas eu acho que a tendência para o git é muito mais pelo kernel linux usá-lo do que por motivos técnicos.

Aqui tem uma comparação entre os 3 softwares citados:

http://versioncontrolblog.com/comparison/Git/Mercurial/Subversion/index.html

http://www.youtube.com/watch?v=4XpnKHJAok8